projet Protegens

Métabolites spécialisés de Pseudomonas protegens contre microorganismes phytopathogènes et insectes ravageurs en biocontrôle

responsables

Alyssa CARRE-MLOUKA (DGIMI, Université de Montpellier) courriel

Stéphane COCIANCICH (PHIM, Cirad) courriel

résumé

Les nématodes entomopathogènes utilisés en biocontrôle sont porteurs d’un microbiote bactérien dont les membres peuvent présenter des activités biologiques d’intérêt, et parmi lesquels Pseudomonas protegens est connue pour ses propriétés insecticide, antimicrobienne et PGPB (Plant Growth Promoting Bacteria). Ce projet interdisciplinaire mêlant des approches de microbiologie, biochimie et chimie analytique s’attachera à en identifier et caractériser les supports moléculaires (métabolites spécialisés ou secondaires) dans un contexte de santé des plantes (cultures de riz et de blé, notamment). Il s’agira de (i) réaliser l’analyse bioinformatique des génomes bactériens afin de mettre en évidence des groupements de gènes de biosynthèse des métabolites spécialisés ; (ii) faire une mise au point des conditions de cultures optimales pour la production en masse de ces métabolites ; (iii) extraire et purifier les métabolites d’intérêt et (iv) réaliser les tests biologiques (insecticide, antimicrobien contre des microorganismes phytopathogènes, PGPB sur la croissance de plants de riz, de blé et de pois). Les impacts de ce projet pourront s’inscrire dans la compréhension de l’activité entomopathogène des nématodes et de leur cortège de bactéries symbiotiques, mais également dans la découverte de nouvelles structures et/ou activités de métabolites spécialisés bactériens, avec d’éventuelles sorties opérationnelles en terme de biocontrôle.