projet Nemariz

Création d’une base de données des Nématodes de la rhizosphère du Riz pour des études approfondies du némabiome

responsables

PHAN Thi Ngan (PHIM, CIRAD) courriel

TRAP Jean (Eco&Sols, IRD) courriel

Résumé

La biodiversité des sols soutient des fonctions écosystémiques essentielles à une agriculture durable. Les nématodes, grâce à leur diversité trophique et leur importance écologique, sont des bioindicateurs clés de la santé des sols et des plantes. Le riz, aliment de base principalement cultivé dans les pays tropicaux, est fortement impacté par les nématodes. L’étude des communautés de nématodes associées à la santé du riz reste un défi en raison de la dépendance à des identifications morphologiques longues et du manque de bases de données de séquences nucléotidiques de référence pour les méthodes moléculaires comme le metabarcoding. Ce projet vise à construire une base de données de référence – nommée NemaRiz – pour les nématodes associés aux agro-écosystèmes rizicoles des pays tropicaux (notamment au Cambodge, au Laos et au Sénégal), grâce au séquençage de l’ADNr et à la création de ressources morphologiques illustrées par des photographies.